29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2107 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  74.15 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  70.07 
 
 		 147 aa  217  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  68.03 
 
 		 174 aa  215  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  68.49 
 
 		 148 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  69.39 
 
 		 147 aa  213  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  66.67 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  61.22 
 
 		 161 aa  189  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  45.52 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  43.45 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  34.69 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  37.24 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  34.72 
 
 		 193 aa  87  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  36.81 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  28.24 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  30.34 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  27.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  26.15 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  26.35 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  25.32 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  25 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  25.95 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>