24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1504 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  97.28 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  91.16 
 
 		 147 aa  276  9e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  47.62 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  44.9 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  45.27 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  44.52 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  46.26 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  43.54 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  43.15 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  95.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  35.86 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  35.17 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  29.17 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  26.02 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>