29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1857 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  54.86 
 
 		 193 aa  165  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  39.58 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  42.75 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  36.81 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  39.01 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  35.46 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  36.11 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  34.27 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  35.42 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  29.86 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  29.93 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  31.3 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  30.77 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  30 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  27.7 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  27.01 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  25.53 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>