15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3513 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  28.77 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3585  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  34.88 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.14 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  31.65 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  26.32 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  38.46 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  27.03 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  27.86 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  27.74 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  26.92 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  27.7 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  25 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>