50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0490 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  43.41 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  43.08 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  46.51 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  45.45 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  35.38 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  43.08 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  38.76 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  43.41 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  40.44 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  38.46 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  35.66 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  35.66 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  35.66 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  33.08 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  31.54 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  34.88 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  35.25 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  32.11 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  32.26 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  31.45 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  25.95 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  33.9 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.47 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  33.6 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  35.71 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  35.71 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  38.61 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  34.69 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  37.65 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  37.65 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  33 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  34.45 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  31.11 
 
 		 161 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  27.17 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  27.03 
 
 		 295 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>