38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2664 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  48.55 
 
 
140 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  44.36 
 
 
142 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  41.61 
 
 
142 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  45.93 
 
 
147 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  43.08 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  42.14 
 
 
143 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  48.44 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  46.81 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  43.18 
 
 
146 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  42.14 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  38.46 
 
 
139 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  40.88 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  36.5 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  36.92 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  35.04 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  31.34 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.93 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  34.11 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  32.5 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  32.33 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  27.27 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  31.65 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  26.61 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  28.79 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  26.35 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  25.9 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  26.35 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  29.79 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  28 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  30.7 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  29.03 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  32.67 
 
 
202 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  28.47 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  30.69 
 
 
200 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>