27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4183 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  100 
 
 		 161 aa  333  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  51.37 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  32.81 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  27.14 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  32.03 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  29.93 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.79 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  26.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  26.52 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  28.12 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  29.2 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  24.81 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  27.87 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  25.58 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  28.24 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.9 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  27.54 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  27.56 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>