23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  28.87 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  31.15 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.71 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  25.9 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  26.67 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  28.47 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  30.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  26.76 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  27.41 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  25.95 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  22.22 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  29.66 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  27.59 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  27.42 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  26.4 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  27.08 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>