32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1685 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  55.56 
 
 
151 aa  176  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  41.38 
 
 
145 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  44.93 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  42.45 
 
 
148 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  42.75 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  37.4 
 
 
193 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  40.46 
 
 
145 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  40.14 
 
 
174 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  37.32 
 
 
147 aa  92  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  37.59 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  35.21 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  37.32 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  33.1 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  32.39 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  34.78 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.37 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  31.39 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  28.37 
 
 
142 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  32.08 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  29.51 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  29.61 
 
 
156 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  30.68 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  31.11 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  23.02 
 
 
169 aa  40.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>