29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0149 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  67.63 
 
 
139 aa  192  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  67.39 
 
 
140 aa  191  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  65.47 
 
 
139 aa  186  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  56.12 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  37.21 
 
 
140 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  34.29 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  30 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  34.68 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  32.56 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  39.37 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  35.29 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  34.78 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  24.62 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  31.45 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  31.45 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  30.28 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  27.62 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  29.2 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  34.94 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  23.39 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  28.36 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.66 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  26.32 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  30.68 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  26.92 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>