23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1066 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  33.08 
 
 
150 aa  88.2  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  35.04 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  36.11 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  31.4 
 
 
140 aa  62  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  29.59 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  27.84 
 
 
140 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  24.81 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  25.19 
 
 
140 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  25.19 
 
 
140 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  26.32 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  27.84 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  27.47 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  26.61 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  27.62 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  27.55 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  23.97 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  23.53 
 
 
139 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  26.32 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.51 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>