24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2267 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  70.83 
 
 		 144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  35.46 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  32.62 
 
 		 193 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  36.55 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  29.08 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  37.24 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  36.73 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  35.62 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  37.24 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  36.91 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  33.79 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  25.9 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  24.82 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  23.45 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>