24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2848 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  55.56 
 
 		 147 aa  176  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  46.76 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  41.01 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  37.41 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  37.41 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  40.14 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  38.73 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  38.3 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  38.73 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  36.81 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  35.37 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  34.51 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  34.46 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  29.58 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  30.83 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  33.81 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  27.82 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>