22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1125 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  333  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  46.9 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  48.28 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  47.26 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  46.9 
 
 		 147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  46.9 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  45.21 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  48.97 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  46.62 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  44.83 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  43.84 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  43.15 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  42.47 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  33.58 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  33.59 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  36.91 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  25.47 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>