24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2807 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  70.83 
 
 		 148 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  44.93 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  39.01 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  36.17 
 
 		 193 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  36.55 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  39.31 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  38.36 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  35.62 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  35.62 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  35.17 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  37.24 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  36.73 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  37.78 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  36.55 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1945  DNA-binding protein  30.15 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  26.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  26.8 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>