27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5223 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  361  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  51.37 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  35.04 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  34.11 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  32.48 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  25.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  26.77 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  27.34 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  28.57 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.55 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  23.39 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  26.67 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  32.29 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  23.28 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.06 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  29.32 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  24.24 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  34.18 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  25.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  27.42 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  26.8 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>