27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0907 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  360  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  73.47 
 
 
147 aa  227  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  72.11 
 
 
147 aa  222  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  68.03 
 
 
147 aa  215  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  65.99 
 
 
147 aa  214  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  72.79 
 
 
147 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  65.52 
 
 
148 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  57.82 
 
 
161 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  47.62 
 
 
147 aa  140  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  47.62 
 
 
147 aa  140  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  46.9 
 
 
168 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  46.58 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  45.89 
 
 
147 aa  131  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  100  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  37.93 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  36.49 
 
 
145 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  34.03 
 
 
193 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  35.62 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  84.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  30.87 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  30.41 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  25.34 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  25.69 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  24.54 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  28.21 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>