29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3860 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  98.1 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  62.82 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  29.5 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  25.69 
 
 		 223 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  29.71 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  26.76 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  23.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  23.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  23.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  23.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  23.84 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  26.95 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  25.48 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  25.48 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  24.84 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  25.34 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  25.48 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  25.5 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  26.15 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  26.24 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  25.41 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  24.66 
 
 		 147 aa  42  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>