29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0790 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  306  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  76.87 
 
 
147 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  73.47 
 
 
147 aa  224  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  72.11 
 
 
174 aa  222  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  69.39 
 
 
147 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  66.21 
 
 
148 aa  208  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  65.31 
 
 
147 aa  202  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  57.14 
 
 
161 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  47.95 
 
 
147 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  45.21 
 
 
168 aa  134  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  126  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  45.21 
 
 
147 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  36.11 
 
 
193 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  84.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  34.25 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  35.21 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  34.93 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  31.72 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  32.65 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  31.08 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  28.19 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  27.89 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  27.94 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  24.66 
 
 
158 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  26.97 
 
 
184 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  24.66 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.57 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>