26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1653 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  76.87 
 
 		 147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  74.15 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  71.72 
 
 		 148 aa  229  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  73.47 
 
 		 174 aa  227  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  73.47 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  71.43 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  57.82 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  47.59 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  46.9 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  37.67 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  40.94 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  39.31 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  38.73 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  34.93 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  57  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  31.19 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  24.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  25.69 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  28.57 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>