23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1255 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  40.85 
 
 
193 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  38.03 
 
 
149 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  40.46 
 
 
147 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  38.24 
 
 
151 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  35.94 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  34.38 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  29.08 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  34.72 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  31.97 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  33.59 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  31.47 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  29.25 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  34.92 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  32.37 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  27.59 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>