46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10920 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  49.62 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  47.1 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  47.79 
 
 
146 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  48.55 
 
 
150 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  47.76 
 
 
147 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  46.27 
 
 
149 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  44.12 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  46.51 
 
 
154 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  41.09 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  38.76 
 
 
139 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  37.21 
 
 
139 aa  103  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  38.85 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  42.4 
 
 
135 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  36.09 
 
 
140 aa  94  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  36.76 
 
 
137 aa  89  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  32.33 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.71 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  31.82 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  27.54 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  28.77 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  31.01 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  29.55 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  26.72 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  29.37 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  27.07 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  27.07 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.13 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  27.84 
 
 
177 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  33.06 
 
 
134 aa  48.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  26.67 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3585  hypothetical protein  26.39 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  24.82 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  25.35 
 
 
156 aa  43.9  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  29.52 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  28.15 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  27.01 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  25.19 
 
 
147 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  27.42 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  28.57 
 
 
290 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  31.03 
 
 
200 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  24.03 
 
 
223 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>