45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0991 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  100 
 
 
146 aa  303  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  52.08 
 
 
149 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  47.79 
 
 
140 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  43.94 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  44.96 
 
 
142 aa  124  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  41.22 
 
 
143 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  45.19 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  43.18 
 
 
150 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  43.08 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  41.6 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  35.51 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  35.29 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  35.25 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  33.9 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  29.01 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  34.15 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.63 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  26.67 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28.43 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  27.87 
 
 
161 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  26.32 
 
 
177 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  29.84 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3585  hypothetical protein  31.29 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.65 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  31.54 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  27.34 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  31.82 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  26.02 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  31.08 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  31.51 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  25 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  32.88 
 
 
285 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  31.88 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  31.3 
 
 
137 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  29.84 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  28.12 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  31.85 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>