50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29448 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  40.43 
 
 
169 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  40.43 
 
 
135 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  41.43 
 
 
134 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  38.32 
 
 
147 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  38.62 
 
 
137 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  37.14 
 
 
134 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  37.78 
 
 
130 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  37.76 
 
 
133 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  37.76 
 
 
133 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  36.23 
 
 
143 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  35.92 
 
 
134 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  39.31 
 
 
144 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  37.06 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  36.23 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  37.06 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  39.1 
 
 
130 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  35.51 
 
 
143 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  34.78 
 
 
143 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  37.06 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  34.59 
 
 
128 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  27.7 
 
 
158 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  32.17 
 
 
156 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  27.13 
 
 
142 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  28.87 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  37.89 
 
 
84 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  27.03 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  33.06 
 
 
203 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  28.17 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  28.46 
 
 
143 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  31.58 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  33.33 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  30.51 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  31.54 
 
 
146 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  30.88 
 
 
140 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  26.13 
 
 
142 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  30.09 
 
 
200 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  33.6 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  30.09 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  30.77 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.29 
 
 
135 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  29.84 
 
 
150 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  29.91 
 
 
200 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>