43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2721 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  291  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  46.76 
 
 
147 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  33.08 
 
 
177 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  39.13 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  35.61 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  37.41 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  32.33 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  32.33 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  34.85 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  37.41 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  29.55 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  31.2 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  34.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  40.35 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  31.25 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  38.26 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  31.82 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  29.77 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  30.28 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.17 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  26.52 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  28.46 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  30.52 
 
 
184 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  29.37 
 
 
223 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  29.92 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  27.89 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  26.95 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  31.11 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  31.33 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  26.71 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>