40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0027 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  52.71 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  50.82 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  48.84 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  48.06 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  50.45 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  47.66 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  49.22 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  45.45 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  44.34 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  39.82 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  38.05 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  38.05 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  38.05 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  38.05 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  38.05 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  38.94 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  38.05 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  38.05 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  35.25 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  37.1 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  39.29 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  32.71 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  33.08 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  28.83 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  32.58 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  28.57 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  45 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  28.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  26.92 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  26.92 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  27.38 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  32.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>