95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0302 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  71.37 
 
 
261 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  71.76 
 
 
261 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  45.04 
 
 
254 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  45.04 
 
 
254 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  44.27 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  45.37 
 
 
247 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  44.49 
 
 
247 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  45.38 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  41.8 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  42.92 
 
 
247 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  41.15 
 
 
248 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  42.57 
 
 
249 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  42.24 
 
 
234 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  43.59 
 
 
234 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  46.98 
 
 
245 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  44.49 
 
 
255 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  42.98 
 
 
248 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  41.53 
 
 
251 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  42.15 
 
 
265 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  51.37 
 
 
150 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  53.1 
 
 
150 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  37.4 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  34.42 
 
 
176 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  26.19 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  38.03 
 
 
87 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  38.03 
 
 
87 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  69.7 
 
 
40 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  40.74 
 
 
112 aa  53.9  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  38.03 
 
 
87 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  41.94 
 
 
200 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  40.32 
 
 
200 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  44.83 
 
 
84 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  41.27 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  38.67 
 
 
86 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  43.1 
 
 
84 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  37.29 
 
 
88 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  38.16 
 
 
87 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  37.33 
 
 
83 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  35.48 
 
 
203 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  38.6 
 
 
85 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  37.7 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
84 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
85 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  27.16 
 
 
202 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
84 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  34.67 
 
 
85 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.35 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  35.62 
 
 
87 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  35.62 
 
 
87 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
84 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  38.98 
 
 
115 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  41.38 
 
 
84 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  37.33 
 
 
87 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  36.51 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  43.1 
 
 
82 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
84 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  36.51 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  35.62 
 
 
86 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.07 
 
 
89 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 
85 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  37.93 
 
 
84 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  27.81 
 
 
395 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  30.65 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  34.92 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36 
 
 
83 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  36.07 
 
 
101 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
101 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  32.76 
 
 
96 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.43 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  34.43 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  38.98 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.43 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  38.33 
 
 
86 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36 
 
 
83 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36 
 
 
83 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36 
 
 
83 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  34.38 
 
 
95 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
86 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  34.85 
 
 
84 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36 
 
 
83 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  36.07 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  41.38 
 
 
88 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  41.38 
 
 
88 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
85 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  34.43 
 
 
203 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  36.25 
 
 
103 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
88 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  41.27 
 
 
84 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  34.48 
 
 
83 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  34.48 
 
 
83 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  40 
 
 
95 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  36.84 
 
 
249 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
86 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>