23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1813 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  100 
 
 
40 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  92.5 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  90 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  52.5 
 
 
261 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  69.7 
 
 
278 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  52.5 
 
 
261 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  46.15 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  48.72 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  54.55 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  44.74 
 
 
249 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  54.55 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  45.71 
 
 
245 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  41.03 
 
 
251 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  46.15 
 
 
255 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  42.11 
 
 
248 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  48.72 
 
 
247 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  48.72 
 
 
247 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  42.11 
 
 
247 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  41.03 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  47.5 
 
 
247 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  44.74 
 
 
234 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  39.47 
 
 
265 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>