64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00406 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  58.3 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  60.34 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  59.23 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  59.23 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  58.37 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  56.47 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  57.51 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  56.47 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  56.03 
 
 		 247 aa  277  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  57.76 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  57.76 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  59.05 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  53.02 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  55.17 
 
 		 245 aa  258  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  52.79 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  50 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  43.59 
 
 		 278 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  41.45 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  41.03 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  35.06 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  36.3 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  27.35 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.93 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  32.54 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  43.1 
 
 		 112 aa  52  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 81 aa  44.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 86 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  37.7 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  35.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  36.21 
 
 		 84 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  35.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  36.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  34.38 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  33.8 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 86 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  33.78 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  34.92 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  33.8 
 
 		 87 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  35.06 
 
 		 89 aa  43.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  37.68 
 
 		 87 aa  42.4  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  37.68 
 
 		 87 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.81 
 
 		 86 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.288339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  37.1 
 
 		 85 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 85 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 84 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 84 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  34.43 
 
 		 238 aa  42  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 84 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 84 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>