142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3931 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  64.08 
 
 		 247 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  65.02 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  66.26 
 
 		 255 aa  328  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  62.9 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  62.75 
 
 		 247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  65.43 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  62.55 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  66.26 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  64.17 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  65.15 
 
 		 245 aa  315  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  60 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  60.16 
 
 		 265 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  59.18 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  60.17 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  59.23 
 
 		 234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  45.04 
 
 		 278 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  43.1 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  42.68 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  37.18 
 
 		 150 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  36.6 
 
 		 150 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  31.07 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  31.52 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  43.28 
 
 		 83 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  40.98 
 
 		 92 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  42.86 
 
 		 85 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  40.32 
 
 		 87 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  42.86 
 
 		 85 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.98 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  48.28 
 
 		 115 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  43.33 
 
 		 85 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  44.26 
 
 		 83 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 86 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  41.67 
 
 		 112 aa  50.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  38.57 
 
 		 85 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  40.98 
 
 		 91 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  42.19 
 
 		 80 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  43.33 
 
 		 85 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  40.98 
 
 		 81 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  41.67 
 
 		 89 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  36.51 
 
 		 87 aa  48.9  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 86 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  36.07 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  39.34 
 
 		 86 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 86 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  37.93 
 
 		 84 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 86 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  38.98 
 
 		 84 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  38.98 
 
 		 84 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  37.93 
 
 		 84 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  39.34 
 
 		 86 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  37.29 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  44.07 
 
 		 89 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  41.94 
 
 		 86 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  40.35 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 86 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  36.84 
 
 		 84 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  39.66 
 
 		 84 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  43.33 
 
 		 86 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 87 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 84 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 83 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 81 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 84 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 84 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  37.29 
 
 		 84 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 84 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 92 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 84 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  38.46 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  39.66 
 
 		 84 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.87 
 
 		 87 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 87 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  32.81 
 
 		 84 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  36.92 
 
 		 84 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  38.33 
 
 		 85 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 		 103 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 87 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  39.66 
 
 		 84 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  31.25 
 
 		 86 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  54.55 
 
 		 40 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  36.76 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  38.71 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  37.7 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 83 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  38.71 
 
 		 84 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 88 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  35.71 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  36.51 
 
 		 85 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>