81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6238 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  94.72 
 
 
249 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  84.96 
 
 
249 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  75 
 
 
248 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  69.01 
 
 
291 aa  360  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  65.57 
 
 
247 aa  359  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  64.75 
 
 
247 aa  354  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  70.95 
 
 
245 aa  345  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  69.01 
 
 
255 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  64.34 
 
 
251 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  62.55 
 
 
254 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  62.55 
 
 
254 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  65.99 
 
 
247 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  64.73 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  56.9 
 
 
234 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  57.51 
 
 
234 aa  281  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  52.87 
 
 
247 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  41.15 
 
 
278 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  40.26 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  39.83 
 
 
261 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  35.06 
 
 
150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  35.33 
 
 
150 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  25.49 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  34.16 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  34.38 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  37.5 
 
 
242 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  42.62 
 
 
238 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  38.71 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  37.1 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  37.1 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36.07 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  36.07 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  38.98 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  36.07 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  37.88 
 
 
101 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  37.88 
 
 
101 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  38.1 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  36.21 
 
 
112 aa  46.2  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  37.93 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  31.31 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.37 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  38.1 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  34.52 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  35.48 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  42.11 
 
 
40 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  44.26 
 
 
94 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  32.91 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  44.26 
 
 
94 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  37.33 
 
 
85 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  39.66 
 
 
102 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
96 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  35.48 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
81 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  36.51 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  34.29 
 
 
82 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  34.29 
 
 
82 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  34.29 
 
 
82 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  29.25 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0884  glutaredoxin  27.06 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  36.36 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  30.12 
 
 
187 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  40.98 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  36.07 
 
 
85 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  38.24 
 
 
85 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  38.24 
 
 
85 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  38.71 
 
 
86 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
85 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
88 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  36.07 
 
 
90 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
85 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  31.58 
 
 
145 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  29.49 
 
 
212 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>