74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2123 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  72.8 
 
 		 245 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  72.08 
 
 		 248 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  64.23 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  68.75 
 
 		 249 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  73.11 
 
 		 247 aa  347  8e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  65.98 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  61.89 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  61.89 
 
 		 247 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  64.73 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  63.93 
 
 		 251 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  65.31 
 
 		 255 aa  324  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  60.66 
 
 		 254 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  60.66 
 
 		 254 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  52.56 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  52.79 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  51.25 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  42.15 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  37.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  36.78 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  34.42 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  33.97 
 
 		 150 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  27.04 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.5 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  29.75 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.32 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  35.48 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  32.18 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  39.19 
 
 		 95 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.82 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  34.33 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  34.43 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  38.24 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 86 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  33.33 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  36.92 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  40.32 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  36.07 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  32.95 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 85 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  36.76 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  32.35 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 85 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  36.76 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  33.93 
 
 		 112 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  36.21 
 
 		 87 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  29.79 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.68 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  43.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  36.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 82 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  35 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  31.88 
 
 		 87 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  30.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  33.87 
 
 		 87 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  30.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 88 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  39.66 
 
 		 85 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 		 87 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 87 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  35.94 
 
 		 85 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 87 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  35.94 
 
 		 85 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>