61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0106 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  86.75 
 
 		 249 aa  460  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  84.96 
 
 		 248 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  83.27 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  67.89 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  68.29 
 
 		 247 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  72.5 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  75.21 
 
 		 245 aa  359  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  67.61 
 
 		 251 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  70.33 
 
 		 255 aa  347  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  69.39 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  65.43 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  65.43 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  68.75 
 
 		 265 aa  334  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  59.66 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  57.76 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  55.51 
 
 		 247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  42.57 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  41.13 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  40.69 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  36.77 
 
 		 150 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  39.34 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  30.82 
 
 		 176 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 		 112 aa  48.9  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  46.15 
 
 		 40 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  34.33 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  38.81 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.82 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  42.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  36.23 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  30.77 
 
 		 95 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.68 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  35.59 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  29.87 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  34.85 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  40.68 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  40.68 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.71 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  37.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  29.87 
 
 		 101 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  39.66 
 
 		 84 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  39.66 
 
 		 84 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 81 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  36.21 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 88 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 		 243 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 		 243 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 		 85 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  38.6 
 
 		 85 aa  42  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>