62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2436 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  75.31 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  74.9 
 
 		 247 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  70.17 
 
 		 249 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  72.5 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  69.01 
 
 		 248 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  74.68 
 
 		 245 aa  358  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  71.07 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  71.67 
 
 		 248 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  64.52 
 
 		 251 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  66.54 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  64.23 
 
 		 265 aa  334  7.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  64.17 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  64.17 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  59.23 
 
 		 234 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  57.76 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  55.56 
 
 		 247 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  44.27 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  45.02 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  44.59 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  43.88 
 
 		 150 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  38.96 
 
 		 150 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  31.06 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.53 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  32.16 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  42.62 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  39.34 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  39.34 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  39.34 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  39.34 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  39.73 
 
 		 86 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.82 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  34.21 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  38.71 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.82 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 82 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  48.72 
 
 		 40 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  28.06 
 
 		 395 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  38.71 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  38.71 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  40.32 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  40.35 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  38.33 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  35.59 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  28.47 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  37.1 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  37.7 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  35.94 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  37.7 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 85 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  33.98 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  34.67 
 
 		 95 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 85 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 84 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  38.96 
 
 		 83 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 		 85 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 84 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 84 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  30.56 
 
 		 101 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>