25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1278 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  54.72 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  34.85 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  33.12 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  33.12 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  34.42 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  34.3 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  34.3 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  28.83 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  29.51 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  34.38 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  32.54 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  33.95 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  32.16 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  36.44 
 
 		 248 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  34.75 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  33.9 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  27.71 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  31.52 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  31.52 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  32.2 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>