25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1892 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  55.35 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  36.15 
 
 
247 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  36.13 
 
 
278 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  34.15 
 
 
247 aa  84.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  39.24 
 
 
245 aa  82  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  34.76 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  29.87 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  34.97 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  30.41 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  30.41 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  33.15 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  33.14 
 
 
247 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  34.78 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  33.13 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  35.4 
 
 
249 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  32.54 
 
 
247 aa  70.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  33.13 
 
 
248 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  36.59 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  29.52 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  30.77 
 
 
254 aa  64.3  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  30.77 
 
 
254 aa  64.3  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  36.07 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>