35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5419 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  64.52 
 
 
291 aa  344  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  64.61 
 
 
247 aa  341  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  64.61 
 
 
247 aa  340  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  64.9 
 
 
249 aa  339  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  67.61 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  64.34 
 
 
248 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  66.12 
 
 
248 aa  333  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  64.94 
 
 
255 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  62.9 
 
 
254 aa  328  6e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  62.9 
 
 
254 aa  328  6e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  64.46 
 
 
265 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  65.13 
 
 
245 aa  310  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  63.07 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  57.26 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  56.47 
 
 
234 aa  279  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  51.84 
 
 
247 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  41.53 
 
 
278 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  39.42 
 
 
261 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  39 
 
 
261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  36.08 
 
 
150 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  35.95 
 
 
150 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  35.22 
 
 
174 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  29.2 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  29.51 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  37.29 
 
 
85 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.98 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  41.03 
 
 
40 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.71 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  38.1 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.71 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  35.94 
 
 
87 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  34.43 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  39.34 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  32.86 
 
 
87 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>