44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3739 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  83.27 
 
 		 249 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  77.05 
 
 		 249 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  75 
 
 		 248 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  71.67 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  66.53 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  66.94 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  74.9 
 
 		 245 aa  354  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  66.12 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  71.07 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  72.08 
 
 		 265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  71.02 
 
 		 247 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  66.26 
 
 		 254 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  66.26 
 
 		 254 aa  331  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  57.94 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  55.1 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  53.02 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  42.98 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  41.53 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  41.1 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  35.48 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  24.64 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  32.7 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  35.82 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  34.25 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  37.7 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35.82 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.82 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.82 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  34.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  32.84 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  41.03 
 
 		 40 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  31.03 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  35.94 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  30.16 
 
 		 87 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  38.46 
 
 		 85 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  38.46 
 
 		 85 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>