26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_12751 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  287  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  93.88 
 
 
150 aa  268  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  53.1 
 
 
278 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  53.79 
 
 
261 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  53.79 
 
 
261 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  41.43 
 
 
255 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  43.88 
 
 
291 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  35.95 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  36.08 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  41.6 
 
 
249 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  39.24 
 
 
247 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  36.13 
 
 
248 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  35.33 
 
 
248 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  37.18 
 
 
254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  37.18 
 
 
254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  40.51 
 
 
247 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  38.36 
 
 
234 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  39.42 
 
 
245 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  38.1 
 
 
265 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  38.52 
 
 
247 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  36.3 
 
 
234 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  42.34 
 
 
247 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  33.07 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  90 
 
 
40 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  26.62 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  28.76 
 
 
247 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>