92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1624 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  74.68 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  71.97 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  70.95 
 
 		 248 aa  363  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  69.29 
 
 		 247 aa  360  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  75.21 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  77.41 
 
 		 247 aa  358  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  68.05 
 
 		 247 aa  355  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  74.9 
 
 		 248 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  72.8 
 
 		 265 aa  347  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  65.15 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  65.15 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  65.13 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  69.75 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  54.8 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  57.08 
 
 		 234 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  55.17 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  46.98 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  43.28 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  42.86 
 
 		 261 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  37.25 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  37.25 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  37.97 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  34.81 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  41.27 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.98 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  36.84 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  44.26 
 
 		 90 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  40.35 
 
 		 85 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 		 81 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 81 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  39.39 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 		 85 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  39.06 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  39.06 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  39.06 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  35 
 
 		 95 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  40.26 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 86 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 85 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  40.26 
 
 		 94 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 86 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 		 88 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  38.71 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 82 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  37.1 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 84 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  36.67 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  45.71 
 
 		 40 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  34.43 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 88 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  40.68 
 
 		 87 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 84 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  39.39 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  38.33 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 84 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  38.98 
 
 		 87 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 83 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  37.14 
 
 		 89 aa  43.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  35.21 
 
 		 83 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  34.48 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  36.07 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 84 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  41.94 
 
 		 84 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  41.94 
 
 		 84 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  35.21 
 
 		 243 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  41.94 
 
 		 247 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>