84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3244 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  68.98 
 
 
249 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  69.01 
 
 
248 aa  358  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  67.89 
 
 
247 aa  357  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  66.54 
 
 
291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  67.07 
 
 
247 aa  353  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  70.33 
 
 
249 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  70.78 
 
 
248 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  66.26 
 
 
254 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  66.26 
 
 
254 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  64.94 
 
 
251 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  69.75 
 
 
245 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  65.31 
 
 
265 aa  315  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  61.97 
 
 
234 aa  308  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  63.67 
 
 
247 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  59.05 
 
 
234 aa  288  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  56.38 
 
 
247 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  44.49 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  43.44 
 
 
261 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  43.85 
 
 
261 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  38.96 
 
 
150 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  38.46 
 
 
150 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  34.26 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.53 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  30.64 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  41.94 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  39.68 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  40.68 
 
 
90 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  34.85 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
85 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  40.91 
 
 
86 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  39.34 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  38.33 
 
 
87 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
85 aa  47  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
88 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
88 aa  46.6  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  33.33 
 
 
85 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  37.5 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
80 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  42.19 
 
 
115 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
88 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
88 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
87 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  36.67 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  30.38 
 
 
95 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  37.88 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  39.34 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
86 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  39.06 
 
 
92 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
85 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
86 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  36.67 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  37.1 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  40.62 
 
 
83 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
83 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  46.15 
 
 
40 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.43 
 
 
84 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
85 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  34.15 
 
 
91 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
94 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
94 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
81 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.43 
 
 
84 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  33.87 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  33.87 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  31.82 
 
 
89 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
85 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>