64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00187 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  58.3 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  60 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  60 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  58.12 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  55.6 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  55.19 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  53.69 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  55.1 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  55.56 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  52.87 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  56.38 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  51.84 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  54.8 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  51.45 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  51.25 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  42.92 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  44.4 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  43.97 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  42.34 
 
 		 150 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  34.15 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  29.69 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  28.83 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  41.67 
 
 		 112 aa  49.7  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  37.29 
 
 		 85 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  39.44 
 
 		 85 aa  47.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.32 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 		 85 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.33 
 
 		 459 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.14 
 
 		 85 aa  45.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  37.29 
 
 		 87 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.87 
 
 		 87 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  36.21 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  40.68 
 
 		 87 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  41.67 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  36.07 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  33.72 
 
 		 95 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  38.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  31.67 
 
 		 85 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  31.67 
 
 		 85 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 88 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  32 
 
 		 90 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  37.7 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 80 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  33.9 
 
 		 86 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  33.82 
 
 		 242 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  32.26 
 
 		 91 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  31.43 
 
 		 85 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2747  glutaredoxin 1  35.38 
 
 		 85 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.877071  normal  0.0409046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.48 
 
 		 84 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0952  glutaredoxin 1  35.38 
 
 		 85 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 89 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  35.09 
 
 		 84 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 89 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>