85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2539 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  94.72 
 
 
248 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  86.75 
 
 
249 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  77.05 
 
 
248 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  67.35 
 
 
247 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  70.17 
 
 
291 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  66.53 
 
 
247 aa  362  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  71.97 
 
 
245 aa  348  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  68.98 
 
 
255 aa  344  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  64.9 
 
 
251 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  65.02 
 
 
254 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  65.02 
 
 
254 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  66.4 
 
 
247 aa  328  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  65.98 
 
 
265 aa  322  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  57.76 
 
 
234 aa  296  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  58.37 
 
 
234 aa  285  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  53.69 
 
 
247 aa  272  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  41.8 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  39.83 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  39.42 
 
 
261 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  35.95 
 
 
150 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  26.74 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  33.95 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  32.14 
 
 
112 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  38.71 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.94 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  40.98 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  38.98 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  37.29 
 
 
243 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  38.1 
 
 
247 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  37.29 
 
 
243 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  37.29 
 
 
243 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  35.59 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  37.93 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 
81 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
81 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  39.39 
 
 
249 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  33 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  36.51 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  44.26 
 
 
94 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  44.26 
 
 
94 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  35.48 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  44.74 
 
 
40 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  39.66 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  33.9 
 
 
85 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  37.5 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  40.91 
 
 
86 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  36.23 
 
 
85 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  33.9 
 
 
85 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  30.26 
 
 
101 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  36.07 
 
 
90 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  34.72 
 
 
110 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  30.26 
 
 
101 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  35 
 
 
85 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  40 
 
 
86 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  32.86 
 
 
82 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  32.86 
 
 
82 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  38.33 
 
 
85 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  38.33 
 
 
85 aa  43.5  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  32.86 
 
 
82 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
88 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  35.29 
 
 
87 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  35.29 
 
 
87 aa  42.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
104 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 
87 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
86 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
104 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  29.11 
 
 
212 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  33.03 
 
 
145 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  31.19 
 
 
145 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  42.62 
 
 
88 aa  42  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  31.94 
 
 
103 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  42.62 
 
 
88 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  36.07 
 
 
85 aa  42  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  28.92 
 
 
187 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>