46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0575 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  91.03 
 
 		 145 aa  266  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  55.04 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  51.16 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  51.72 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  49.59 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  40.34 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  39.39 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  45.45 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  31.3 
 
 		 167 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  33.1 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  41.41 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  40.37 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  35.66 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  37.5 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  40.74 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  38.05 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  39.16 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  37.76 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  41.79 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  42.31 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  37.4 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.25 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  37.88 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  37.04 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  36.36 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  36.64 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  34.75 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  41.28 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  30.61 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  31.47 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  31.67 
 
 		 373 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  34.96 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  38.46 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  32.84 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  32.48 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  29.23 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  34.31 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  35.64 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  42.59 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3020  hypothetical protein  42.03 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  25.55 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  31.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  31.19 
 
 		 249 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2294  hypothetical protein  38.95 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  23.02 
 
 		 363 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>