30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1167 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  63.86 
 
 		 170 aa  175  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  50.9 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  43.51 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  50.98 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  49.39 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  45.14 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  52.78 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  43.23 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  41.18 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  41.18 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  44.3 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  38.17 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  42.47 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.17 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  34.59 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  34.38 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  35.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32.31 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  39.39 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  40 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  32.17 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  26.92 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  36.21 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  25.86 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  30.15 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  31.47 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  35.29 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>