40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2522 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  49.24 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  52.89 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  49.59 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  49.59 
 
 
138 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  43.94 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  40.38 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  36.8 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  36.27 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  36.45 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  38.26 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  36.36 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  37.1 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  33.59 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39.64 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  37.82 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  35.16 
 
 
174 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  36.73 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  40 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  35.16 
 
 
174 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  44.95 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  44.54 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32.62 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  36.46 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  40.2 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  38.68 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  36.54 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  36.63 
 
 
193 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  34.38 
 
 
191 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  38.04 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  25.18 
 
 
362 aa  47.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  29.92 
 
 
373 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.36 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.74 
 
 
364 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  27.74 
 
 
360 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  32.2 
 
 
179 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  31.51 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  32.71 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>