44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3921 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  100 
 
 		 146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  56.52 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  55.07 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  51.72 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  52.41 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  43.94 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  36.92 
 
 		 167 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  40.8 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  36.72 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  39.84 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  31.54 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  43.97 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  41.53 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  33.82 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  39.84 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  37.3 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  45.1 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.54 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  31.62 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  31.11 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  38.52 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  37.29 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  38.52 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  30 
 
 		 362 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  35.45 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  43.44 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  36.28 
 
 		 228 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  34.82 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  29.84 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  37.4 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  30.16 
 
 		 383 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  39.71 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  37.5 
 
 		 188 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  35.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  32.74 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  24.84 
 
 		 360 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.48 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  38.03 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  25 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  23.78 
 
 		 380 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  37.25 
 
 		 170 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  35.77 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>