15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0221 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  100 
 
 		 363 aa  734    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  60.71 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  37.7 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  37.5 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  36.71 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  36.1 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  37.47 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  29.83 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  28.33 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4386  hypothetical protein  23.4 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760576  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  26.17 
 
 		 138 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  25.32 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  24.04 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  25.37 
 
 		 138 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  23.02 
 
 		 145 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>