26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13498 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  51.4 
 
 
373 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  48.91 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  37.81 
 
 
363 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  36.44 
 
 
362 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  37.17 
 
 
383 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  35.23 
 
 
380 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  31.55 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  25.2 
 
 
360 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  30.66 
 
 
146 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  30.61 
 
 
145 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  24.91 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  27.66 
 
 
138 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  29.5 
 
 
167 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  28.17 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  25.18 
 
 
138 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4386  hypothetical protein  26.34 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.760576  normal  0.264684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  25.45 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  26.06 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  27.94 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  27.54 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  27.82 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  27.03 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  27.62 
 
 
151 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  26.55 
 
 
188 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  32.65 
 
 
138 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>