15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2314 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2314  DoxX family protein  100 
 
 		 380 aa  778    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.024139  hitchhiker  0.00460046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0221  DoxX family protein  60.71 
 
 		 363 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000153641  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  34.78 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  35.23 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  34.95 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  37.02 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  35.45 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  29.69 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  31.49 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  29.63 
 
 		 145 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  25.55 
 
 		 138 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  29.63 
 
 		 145 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  24.82 
 
 		 138 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  23.78 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1165  hypothetical protein  22.78 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>